Категория
Химия
Тип
реферат
Страницы
7 стр.
Дата
27.11.2008
Формат файла
.rtf — Rich Text Format (Wordpad)
Архив
7801.zip — 36.93 kb
  • vzaimodejstvija-belkov-s-rnk-strukturnyj-kompjuternyj-analiz_7801_1.rtf — 261.75 Kb
  • Readme_docus.me.txt — 125 Bytes
Оцените работу
Хорошо  или  Плохо



Текст работы

Взаимодействия белков с РНК – структурный компьютерный анализ Alena
Alena
Взаимодействия белков с РНК – структурный компьютерный анализ
Курсовая работа
Выполнила студентка 4 курса, 541 группы Ревтович Светлана
Самарский Государственный Университет
Самара 2001
Введение
1. Обзор литературы
1.1. Отличия ДНК-белковых от РНК-белковых взаимодействий
Двойная спираль ДНК – это регулярная структура, в которой наиболее существенные отличия между соседними участками заключены в последовательности пар оснований. В обоих желобках специфический сайт ДНК для узнавания белком может быть сформирован сетью водородных связей между основаниями нуклеотидов
. Большой желобок спирали ДНК доступнее для контакта, что создаёт возможность для дискриминации последовательностей в нём [39]. Основанный на этом
предположении механизм узнавания «прямым считыванием» был подтверждён для многих ДНК-связывающих белков. Также было отмечено потенциальное значение и «непрямого считывания». Некоторые последовательности ДНК могут иметь изменения в конформации сахаро-фосфатного остова или даже быть деформированы в необычные структуры. В таком случае специфичность связывания может определяться контактами белка с остовом ДНК [40]. Индуцированные белком нарушения структуры ДНК довольно обычны и могут варьировать по форме от небольших изгибов, как в сайте нуклеазы EcoRI, до больших изгибов и выведения оснований из стэкинга, как в комплексе с ТАТА-связывающим белком [24].
Механизм «прямого считывания» предполагает, что ДНК-белковыми контактами, определяющими специфичность связывания, являются водородные связи с основаниями и гидрофобные контакты с тиминовыми метилами, в то время
как энергия неспецифического связывания обеспечивается




Ваше мнение



CAPTCHA