Категория
Биология
Тип
дипломная работа
Страницы
21 стр.
Дата
03.05.2013
Формат файла
.html — Html-документ
Архив
488734.zip — 12.01 kb
Оцените работу
Хорошо  или  Плохо


Текст работы

Введение


В настоящее время одной из важных задач молекулярной биологии является математическое моделирование пространственных структур нуклеиновых кислот: дезоксирибонуклеиновых кислот (ДНК) и рибонуклеиновых кислот (РНК). Важность этой задачи обуславливается тем, что основные параметры и процессы функционирования клетки какого-либо организма в первую очередь зависят именно от пространственной структуры её молекул.

Под пространственной структурой РНК (ДНК) понимается третичная структура молекулы, у которой задана вторичная структура. Вторичная структура молекулы РНК (ДНК) - это структура Уотсон-Криковских связей, попарно связывающих нуклеотиды в молекулярной цепи. В постановке данной задачи вторичная структура заданной молекулы предполагается заранее известной из молекулярной биологии. Третичная структура для РНК (ДНК) - это какая-то форма в трёхмерном пространстве, которую принимает её молекулярная цепь под действием Уотсон-Криковских и более слабых связей. Число потенциально возможных третичных структур у молекулы РНК (ДНК) с заданной вторичной структурой очень велико и практически ничем не ограничено.

Для определения пространственной структуры молекулы, на практике чаще всего используется рентгеноструктурный анализ. Однако этот физический метод является довольно длительным и затратным, в связи с чем и возникает потребность в менее трудоёмких методах определения пространственной структуры. В работе [7] был предложен способ моделирования сворачивания молекулы РНК на полноатомном уровне. Такой подход позволяет добиться высокой точности результатов, но требует длительного времени для расчёта необходимой пространственной структуры. Одним из менее точных, но зато более быстрых способов является математическое моделирование третичной структуры молекулы в виде набора тонких упругих стержней, который и будет рассмотрен в данной работе.

Из молекулярной биологии нам известно, что молекулярная цепь РНК (ДНК) составляется из нуклеотидов четырёх видов:



Ваше мнение



CAPTCHA