Категория
Информатика
Тип
дипломная работа
Страницы
52 стр.
Дата
15.04.2013
Формат файла
.html — Html-документ
Архив
391871.zip — 28.52 kb
  • instrumentalnoe-sredstvo-poiska-reguljatornyx-motivov-v-genomax_391871_1.html — 132.27 Kb
  • Readme_docus.me.txt — 125 Bytes
Оцените работу
Хорошо  или  Плохо


Текст работы

Инструментальное средство поиска регуляторных мотивов в геномах


Введение


В процессе жизнедеятельности клетки не все гены экспрессируются одновременно. Это достигается за счет регуляции. Понимание механизма регуляции экспрессии генов - важнейшая задача биологии. При изучении регуляции экспрессии на уровне транскрипции важно не только определить белки-регуляторы (транскрипционные факторы), но и участки их связывания с последовательностью ДНК. В настоящее время в открытом доступе находится большое количество секвенированных геномов и данных по экспрессии генов, что позволяет изучать регуляцию путем анализа последовательностей с помощью вычислительных методов. Задача поиска регуляторных мотивов в наборе последовательностей ДНК - классическая задача биоинформатики. К настоящему моменту создано огромное количество алгоритмов поиска мотивов, однако все они имеют свои ограничения, и не существует универсального алгоритма, который решает эту задачу.

Известно, что алгоритмы, комбинирующие различные методы, наиболее эффективны и универсальны. В данной работе мы представляем алгоритм поиска мотивов в последовательностях ДНК, совмещающий словарные техники и методики, использующие скрытые марковские модели (СММ).

Текст работы содержит следующие основные разделы: введение, обзор литературы, материалы и методы, результаты, заключение, выводы и список цитируемой литературы. В литературном обзоре рассматриваются биологические аспекты задачи, а также описывается классификация методов и основные существующие алгоритмы поиска мотивов. В материалах и методах подробно рассказывается об устройстве базового алгоритма и о его модификациях. В результатах описывается тестирование алгоритма на различных данных, а также сравнение его работы с некоторыми другими алгоритмами.



Ваше мнение



CAPTCHA